bioの被依存関係 以下のgemの最新版はbioを必要としています
bio-kb-illumina 0.1.0
Provide access to the IlluminaHumanAnnotations. Database comes form Bioconductor's pack...
10,009 ダウンロード数
mspire-sequest 0.2.7
reads .SRF, .SQT and supports conversions
9,958 ダウンロード数
bio-core 0.0.1
Bioruby core plugins
9,480 ダウンロード数
bio-core 0.0.1
Bioruby core plugins
9,480 ダウンロード数
bio-wolf_psort_wrapper 0.0.3
Enables the localisation predictor WoLF PSORT to be run locally. The algorithm is avail...
9,259 ダウンロード数
bio-cnls_screenscraper 0.3.0
Programmatic interface to the cNLS nuclear localisation signal prediction software
9,233 ダウンロード数
bio-mummer 0.2.1
Help for working with the output of the .delta files produced by nucmer and promer
8,910 ダウンロード数
bio-hmmer_model 0.0.2
Parse PFAM HMM definition files so that the models can be accessible programmatically
8,799 ダウンロード数
bio-gag 0.1.0
bio-gag is a biogem for detecting and correcting a particular type of error that occurs...
8,754 ダウンロード数
qu-utils 1.0.3
Useful class or methods used in qu-* projects.
8,161 ダウンロード数
ensemblrest 1.1.1
Ensembl REST Ruby API
7,992 ダウンロード数
bio-hmmer3_report 0.1.0
Enables programmatic parsing of HMMER version 3 reports
7,967 ダウンロード数
sylfy 0.1.0
Systems Biology Library for Ruby
7,856 ダウンロード数
ezgff 0.0.6
Utilities for GFF3, the genome annotation format. Useful to explore the gene model feat...
7,821 ダウンロード数
bio-gggenome 0.2.0
A Ruby client for GGGenome the Ultrafast sequence search
7,738 ダウンロード数
bio-ensembl-rest 0.2.0
A Ruby library for the RESTful Ensembl API.
7,693 ダウンロード数
bio-old-biofetch-emulator 1.0.0
Emulator that emulates Bio::Fetch object in BioRuby as if old BioRuby BioFetch server w...
7,617 ダウンロード数
bio-statsample-glm 0.1.1
Statsample-GLM is an extension to Statsample, an advance statistics suite in Ruby. This...
7,591 ダウンロード数
mizlab 0.1.7
The tools for our laboratory
7,469 ダウンロード数
bio-ipcress 0.1.0
a programmatic interface to the iPCRess in-silico PCR software. iPCRess is part of the ...
7,368 ダウンロード数
bio-express_beta_diversity 0.1.0
Interface for express beta diversity file formats
7,362 ダウンロード数
bio-cigar 0.1.0
A parser for CIGAR format alignments.
7,196 ダウンロード数
bio-shell 1.0.1
BioRuby Shell is a command line interface on BioRuby open source bioinformatics library...
7,138 ダウンロード数
bio-samtools-server 0.1.2
A minimal web service on the top of sinatra to query bam files
7,069 ダウンロード数
neurohmmer 0.1.2
Identify Neuropeptides using powerful Hidden Markov Models. For further information p...
7,012 ダウンロード数
ruby-band 0.1.13
Data mining and machine learning algorithms for JRuby
6,614 ダウンロード数
bio-nwk 0.1.4
Some codes for parsing newick tree
6,576 ダウンロード数
bio-gfastqc 0.0.4
Bioinformatics. Aggregate FastQC (quality control for Next Generation Sequencing -NGS-)...
6,232 ダウンロード数
bio-pangenome 0.1.3
Tools to find similarity between pangenomes.
5,707 ダウンロード数
bio-sge 0.0.0
Entries in a flatfile will be parased by the BioRuby's Bio::FlatFile.auto module. These...
5,630 ダウンロード数