bioの被依存関係 以下のgemの最新版はbioを必要としています
bio-hello 0.0.0
Encode any message string into a DNA sequence
5,571 ダウンロード数
bio-restriction_enzyme 1.0.0
Digests DNA based on restriction enzyme cut patterns
5,529 ダウンロード数
bio-executables 1.0.0
BioRuby executables is a collection of miscellaneous utilities for bioinformatics that ...
5,515 ダウンロード数
bio-emboss_six_frame_nucleotide_sequences 0.1.0
a method to get the nucleotide sequence of translations done by the EMBOSS bioinformati...
5,419 ダウンロード数
bio-core-ext 0.0.1
BioRuby plugins with dependecies from external library or tools
5,306 ダウンロード数
bio-biolinux 0.1.0
Meta package for BioLinux distribution: bio-core, bio-core-ext
5,302 ダウンロード数
bio-data-restriction_enzyme 1.109.0
Restriction Enzyme Dataset from REBASE in yaml form
5,287 ダウンロード数
dna_sequence_aligner 0.0.2
does high pairwise alignment of sequencing reads with a template using bioruby and clus...
5,279 ダウンロード数
bio-ensembl 1.1.0
This API provides a complete set of methods and classes to access the Ensembl database ...
5,272 ダウンロード数
bio-ensembl 1.1.0
This API provides a complete set of methods and classes to access the Ensembl database ...
5,272 ダウンロード数
bio-dbsnp 0.1.1
decoding the dbSNP bitfield containg detaild information
5,225 ダウンロード数
bio-hydropathy 0.0.1
Hydropathy scale for BioRuby
5,196 ダウンロード数
bio-aliphatic_index 0.0.1
A simple biogem that allows computation of the aliphatic index of a protein
5,180 ダウンロード数
bio-foo 0.0.0
longer description of your gem
5,173 ダウンロード数
bio-phyloxml 0.9.0
Provides PhyloXML support for BioRuby.
5,169 ダウンロード数
bio-exportpred 0.0.1
Wrapper around the ExportPred algorithm for predicting P. falciparum exported proteins....
5,153 ダウンロード数
bio-blast_seq_extract 0.2.5
Extract the sequence of the subjects' region based on blast search.
4,977 ダウンロード数
bio-img_metadata 0.0.1
Reads metadata from Integrated Microbial Genomes (IMG) metadata files into a programmat...
4,773 ダウンロード数
bio-stockholm 0.0.1
Parses stockholm sequence alignment format
4,647 ダウンロード数
bio-raxml 0.1.0
Just a test
4,484 ダウンロード数
rubst 0.0.1
Rewrite of Kenji's subst (http://www-cryst.bioc.cam.ac.uk/~kenji/subst/) in Ruby progra...
4,462 ダウンロード数
bioruby-phyloxml 1.0.0
Provides PhyloXML support for BioRuby. This bioruby-phyloxml gem replaces old unmaintai...
3,955 ダウンロード数
bio-faidx 0.0.1
ools to work with fasta files, indexed with samtools. The initial releases depend on bi...
3,945 ダウンロード数
bio-blat-tools 0.1.0
Tools to manipulate blat files from the command line. Uses the Bio::Blat object from Bi...
3,885 ダウンロード数
bio-location-rdfize 0.0.0
This is a BioRuby plugin providing FALDO location RDF output method for Bio::Location o...
3,875 ダウンロード数
genomichdt 0.0.1
A Sinatra RESTful web-service for sharing RDFized genomic data.
3,729 ダウンロード数
bio-kallisto 0.1.0
Basic wrapper for the Kallistio Mapper
3,581 ダウンロード数
bio-jaspar 0.1.0
Basic tools for parsing, searching, and comparing JASPAR motifs; Based on Bio.motifs mo...
3,509 ダウンロード数
jandot-ruby-ucsc-api 0.9
ruby-ucsc-api provides a ruby API to the UCSC databases (http://genome.ucsc.edu)
3,435 ダウンロード数
jandot-ruby-ensembl-api 0.9.2
ensembl-api provides a ruby API to the Ensembl databases (http://www.ensembl.org)
3,387 ダウンロード数